Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RINT1Q6NUQ1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms