Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSAPQ6IQ19 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCSAPQ6IQ19 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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