Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3ipQ68EF0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3ipQ68EF0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms