Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD13Q5VXD3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms