Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUSD4Q5VX71 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms