Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP6Q5VW22 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms