Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFAP70Q5T0N1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP70Q5T0N1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms