Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF3Q5SZQ8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms