Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HABP4Q5JVS0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HABP4Q5JVS0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms