Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC27Q2M243 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms