Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM187BQ17R55 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM187BQ17R55 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms