Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F4Q16254 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms