Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPAQ15257 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPAQ15257 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms