Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN1Q15223 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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