Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP1BQ14684 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
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