Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBR1Q14596 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBR1Q14596 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms