Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DDX39BQ13838 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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