Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF5Q13568 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms