Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF4BQ13523 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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