Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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