Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RNF187-202ENST00000482739 2467 ntTSL 515.3■□□□□ 0.041e-9■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-7■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.43e-7■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.873e-7■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ELOC-203ENST00000519082 634 ntTSL 216.69■□□□□ 0.263e-7■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-7■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.663e-7■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.183e-7■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 323.83■■□□□ 1.416e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.246e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.196e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.036e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.026e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-205ENST00000610414 1251 ntTSL 221.32■■□□□ 16e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-209ENST00000612772 1375 ntTSL 320.34■□□□□ 0.856e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.716e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.546e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 215.93■□□□□ 0.146e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.111e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.561e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.082e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 CES2-201ENST00000317091 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 DNPH1-204ENST00000509253 834 ntTSL 336.44■■■■□ 3.427e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.967e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.467e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 RNF5-204ENST00000487940 357 ntTSL 219.23■□□□□ 0.674e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 DCXR-212ENST00000579842 715 ntTSL 324.26■■□□□ 1.474e-13■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 DCXR-216ENST00000582074 631 ntTSL 313.37□□□□□ -0.274e-13■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 DCXR-203ENST00000577532 573 ntTSL 310.08□□□□□ -0.84e-13■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.932e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 FUOM-205ENST00000465384 867 ntTSL 224.09■■□□□ 1.458e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.318e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.18e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.958e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 FUOM-204ENST00000447176 590 ntTSL 217.38■□□□□ 0.378e-8■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 PLCG1-215ENST00000608689 969 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 PLCG1-217ENST00000609257 956 ntTSL 515.37■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 PLCG1-214ENST00000607954 1005 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 PLCG1-219ENST00000612731 544 ntTSL 314.27□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 PLCG1-216ENST00000608885 865 ntTSL 510.05□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 59.72□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 PLCG1-218ENST00000609821 570 ntTSL 57.96□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 22.5
PABPC4Q13310 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.125e-8■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.985e-8■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-21■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.124e-21■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.811e-12■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 ID3-202ENST00000463312 623 ntTSL 214.64□□□□□ -0.071e-12■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.514e-11■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.54e-11■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.384e-11■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.931e-14■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.871e-14■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-14■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.654e-6■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.164e-6■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.762e-8■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 223.23■■□□□ 1.312e-8■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.312e-8■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-8■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 NDUFV2-203ENST00000465096 643 ntTSL 26.75□□□□□ -1.332e-8■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.888e-14■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.798e-14■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.768e-14■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.678e-14■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.678e-14■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.538e-14■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.043e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.013e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.793e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.593e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MRPL52-205ENST00000432849 411 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MRPL52-204ENST00000397505 333 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.443e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MRPL52-214ENST00000556654 362 ntTSL 38.69□□□□□ -1.023e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.212e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.882e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.942e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 519.11■□□□□ 0.652e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.552e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.392e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.092e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 CD63-207ENST00000548898 727 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 CD63-206ENST00000548160 648 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-9■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MRPS33-208ENST00000496641 541 ntTSL 213.31□□□□□ -0.284e-7■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 MRPS33-207ENST00000485202 535 ntTSL 26.78□□□□□ -1.324e-7■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 NAXE-205ENST00000488840 529 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 RFK-203ENST00000476087 554 ntTSL 46.06□□□□□ -1.442e-7■■■■□ 22.4
PABPC4Q13310 VAT1-209ENST00000592388 478 ntTSL 59.26□□□□□ -0.931e-9■■■■□ 22.3
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