Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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