Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 TRS65YGR166W 1683 nt0.14□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.14□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.14□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.14□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YDR102CYDR102C 333 nt0.13□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.13□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.13□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YFL019CYFL019C 354 nt0.12□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.12□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 BUL2YML111W 2763 nt0.11□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YNL028WYNL028W 318 nt0.11□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YPR012WYPR012W 255 nt0.11□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YGL149WYGL149W 306 nt0.1□□□□□ -2.39
NFI1Q12216 YDR366CYDR366C 399 nt0.09□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.09□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 COX12YLR038C 252 nt0.09□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.09□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 SNU13YEL026W 381 nt0.08□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 YAF9YNL107W 681 nt0.08□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 YPR197CYPR197C 564 nt0.08□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.07□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 YKU70YMR284W 1809 nt0.06□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 YGR069WYGR069W 336 nt0.03□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 YOL014WYOL014W 375 nt0.03□□□□□ -2.4
NFI1Q12216 ATP6Q0085 780 nt0.02□□□□□ -2.41
NFI1Q12216 snR36snR36 182 nt0.02□□□□□ -2.41
NFI1Q12216 RPM2YML091C 3609 nt0.01□□□□□ -2.41
NFI1Q12216 YEL073CYEL073C 324 nt0.01□□□□□ -2.41
NFI1Q12216 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-0.01□□□□□ -2.41
NFI1Q12216 QCR9YGR183C 201 nt-0.01□□□□□ -2.41
NFI1Q12216 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.02□□□□□ -2.41
NFI1Q12216 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.02□□□□□ -2.41
NFI1Q12216 RPL39YJL189W 156 nt-0.03□□□□□ -2.41
NFI1Q12216 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-0.05□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 YLR232WYLR232W 348 nt-0.06□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 YOR015WYOR015W 360 nt-0.06□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 GLG1YKR058W 1851 nt-0.07□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.07□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 YFL032WYFL032W 321 nt-0.07□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.07□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 HMRA1YCR097W 381 nt-0.09□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.09□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 SOV1YMR066W 2697 nt-0.09□□□□□ -2.42
NFI1Q12216 CSE1YGL238W 2883 nt-0.1□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 snR128snR128 126 nt-0.1□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 UTP8YGR128C 2142 nt-0.11□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.11□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 YKL118WYKL118W 312 nt-0.11□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-0.11□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 RAD61YDR014W 1944 nt-0.13□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 snR74snR74 88 nt-0.13□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 YDR210WYDR210W 228 nt-0.13□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 YGL052WYGL052W 306 nt-0.13□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-0.13□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 YDR413CYDR413C 576 nt-0.14□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 snR45snR45 172 nt-0.14□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.15□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 YBR099CYBR099C 384 nt-0.15□□□□□ -2.43
NFI1Q12216 snR8snR8 190 nt-0.16□□□□□ -2.44
NFI1Q12216 GIM4YEL003W 336 nt-0.16□□□□□ -2.44
NFI1Q12216 APQ12YIL040W 417 nt-0.16□□□□□ -2.44
NFI1Q12216 YER097WYER097W 330 nt-0.17□□□□□ -2.44
NFI1Q12216 YDR544CYDR544C 429 nt-0.18□□□□□ -2.44
NFI1Q12216 TAH1YCR060W 336 nt-0.2□□□□□ -2.44
NFI1Q12216 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
NFI1Q12216 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.21□□□□□ -2.44
NFI1Q12216 EST1YLR233C 2100 nt-0.21□□□□□ -2.44
NFI1Q12216 PRP39YML046W 1890 nt-0.22□□□□□ -2.45
NFI1Q12216 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.25□□□□□ -2.45
NFI1Q12216 COG6YNL041C 2520 nt-0.26□□□□□ -2.45
NFI1Q12216 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-0.28□□□□□ -2.45
NFI1Q12216 snR46snR46 197 nt-0.28□□□□□ -2.45
NFI1Q12216 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.29□□□□□ -2.46
NFI1Q12216 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-0.29□□□□□ -2.46
NFI1Q12216 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-0.3□□□□□ -2.46
NFI1Q12216 YGR164WYGR164W 336 nt-0.32□□□□□ -2.46
NFI1Q12216 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-0.33□□□□□ -2.46
NFI1Q12216 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.33□□□□□ -2.46
NFI1Q12216 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.33□□□□□ -2.46
NFI1Q12216 YGL041CYGL041C 204 nt-0.34□□□□□ -2.46
NFI1Q12216 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.35□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.35□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 SEC10YLR166C 2616 nt-0.36□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 snR56snR56 88 nt-0.36□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.36□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 snR55snR55 98 nt-0.37□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 YER181CYER181C 324 nt-0.37□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 YGL182CYGL182C 324 nt-0.38□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-0.39□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.39□□□□□ -2.47
NFI1Q12216 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.41□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.41□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.42□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 snR49snR49 165 nt-0.42□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 snR65snR65 100 nt-0.44□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 YEL014CYEL014C 306 nt-0.44□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.44□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 URB1YKL014C 5295 nt-0.46□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.47□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.47□□□□□ -2.48
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