Protein–RNA interactions for Protein: Q12026

YLR053C, Putative uncharacterized protein YLR053C, yeast

Predictions only

Length 108 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR053C	Q12026	CSE2	YNR010W	450 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
YLR053C	Q12026	snR33	snR33	183 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
YLR053C	Q12026	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
YLR053C	Q12026	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YLR053C	Q12026	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YLR053C	Q12026	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YLR053C	Q12026	YMR193C-A	YMR193C-A	387 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YLR053C	Q12026	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	YGR069W	YGR069W	336 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	YLR434C	YLR434C	384 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	YNR025C	YNR025C	360 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	YLL019W-A	YLL019W-A	93 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
YLR053C	Q12026	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
YLR053C	Q12026	snR78	snR78	87 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
YLR053C	Q12026	APQ12	YIL040W	417 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
YLR053C	Q12026	YER079W	YER079W	633 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
YLR053C	Q12026	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
YLR053C	Q12026	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
YLR053C	Q12026	YDR048C	YDR048C	315 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
YLR053C	Q12026	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
YLR053C	Q12026	snR36	snR36	182 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
YLR053C	Q12026	YDR544C	YDR544C	429 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
YLR053C	Q12026	YER137W-A	YER137W-A	306 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
YLR053C	Q12026	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
YLR053C	Q12026	COG6	YNL041C	2520 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
YLR053C	Q12026	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
YLR053C	Q12026	HMRA1	YCR097W	381 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
YLR053C	Q12026	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
YLR053C	Q12026	TAH1	YCR060W	336 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
YLR053C	Q12026	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
YLR053C	Q12026	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
YLR053C	Q12026	YJL182C	YJL182C	318 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
YLR053C	Q12026	snR60	snR60	104 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
YLR053C	Q12026	YGL052W	YGL052W	306 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
YLR053C	Q12026	YLR406C-A	YLR406C-A	150 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
YLR053C	Q12026	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
YLR053C	Q12026	ATP19	YOL077W-A	207 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
YLR053C	Q12026	YOR121C	YOR121C	306 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
YLR053C	Q12026	YLR202C	YLR202C	327 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	snR161	snR161	161 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YDL158C	YDL158C	309 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YGL149W	YGL149W	306 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YAF9	YNL107W	681 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	snR49	snR49	165 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YML099W-A	YML099W-A	330 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	BIL1	YOR304C-A	231 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YBR285W	YBR285W	435 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
YLR053C	Q12026	YKL063C	YKL063C	504 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
YLR053C	Q12026	YOR015W	YOR015W	360 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
YLR053C	Q12026	YIL032C	YIL032C	357 nt		-1.5	□□□□□ -2.65
YLR053C	Q12026	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
YLR053C	Q12026	YOR170W	YOR170W	306 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
YLR053C	Q12026	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
YLR053C	Q12026	YNL028W	YNL028W	318 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
YLR053C	Q12026	YLR154W-F	YLR154W-F	141 nt		-1.54	□□□□□ -2.66
YLR053C	Q12026	YNL324W	YNL324W	396 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
YLR053C	Q12026	HTL1	YCR020W-B	237 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
YLR053C	Q12026	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
YLR053C	Q12026	YGL182C	YGL182C	324 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
YLR053C	Q12026	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
YLR053C	Q12026	snR74	snR74	88 nt		-1.61	□□□□□ -2.67
YLR053C	Q12026	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
YLR053C	Q12026	snR69	snR69	101 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
YLR053C	Q12026	ATP6	Q0085	780 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
YLR053C	Q12026	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
YLR053C	Q12026	YGR035C	YGR035C	351 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
YLR053C	Q12026	YNL266W	YNL266W	420 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
YLR053C	Q12026	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
YLR053C	Q12026	YDR102C	YDR102C	333 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
YLR053C	Q12026	YFL032W	YFL032W	321 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
YLR053C	Q12026	snR50	snR50	90 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
YLR053C	Q12026	JLP2	YMR132C	627 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
YLR053C	Q12026	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
YLR053C	Q12026	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
YLR053C	Q12026	RDS3	YPR094W	324 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
YLR053C	Q12026	YER097W	YER097W	330 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
YLR053C	Q12026	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
YLR053C	Q12026	snR189	snR189	189 nt		-1.82	□□□□□ -2.7
YLR053C	Q12026	YGL041C	YGL041C	204 nt		-1.84	□□□□□ -2.7
YLR053C	Q12026	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
YLR053C	Q12026	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
YLR053C	Q12026	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
YLR053C	Q12026	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
YLR053C	Q12026	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
YLR053C	Q12026	snR67	snR67	82 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
YLR053C	Q12026	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
YLR053C	Q12026	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
YLR053C	Q12026	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.95	□□□□□ -2.72
YLR053C	Q12026	snR39B	snR39B	96 nt		-1.95	□□□□□ -2.72
YLR053C	Q12026	YJR157W	YJR157W	363 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
YLR053C	Q12026	YFL019C	YFL019C	354 nt		-1.97	□□□□□ -2.72

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