Protein–RNA interactions for Protein: Q12024

YTM1, Ribosome biogenesis protein YTM1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTM1Q12024 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.19□□□□□ -2.22
YTM1Q12024 FYV10YIL097W 1551 nt1.18□□□□□ -2.22
YTM1Q12024 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.18□□□□□ -2.22
YTM1Q12024 YGR130CYGR130C 2451 nt1.17□□□□□ -2.22
YTM1Q12024 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.17□□□□□ -2.22
YTM1Q12024 NST1YNL091W 3723 nt1.17□□□□□ -2.22
YTM1Q12024 IML1YJR138W 4755 nt1.13□□□□□ -2.23
YTM1Q12024 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.13□□□□□ -2.23
YTM1Q12024 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.13□□□□□ -2.23
YTM1Q12024 YNL338WYNL338W 159 nt1.12□□□□□ -2.23
YTM1Q12024 YLR294CYLR294C 330 nt1.11□□□□□ -2.23
YTM1Q12024 YDL073WYDL073W 2955 nt1.11□□□□□ -2.23
YTM1Q12024 SCC2YDR180W 4482 nt1.1□□□□□ -2.23
YTM1Q12024 TAH1YCR060W 336 nt1.09□□□□□ -2.23
YTM1Q12024 YGL182CYGL182C 324 nt1.09□□□□□ -2.23
YTM1Q12024 SIP4YJL089W 2490 nt1.09□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.08□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.08□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.08□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 YLR232WYLR232W 348 nt1.07□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 RKR1YMR247C 4689 nt1.06□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 YOR170WYOR170W 306 nt1.05□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 UBP3YER151C 2739 nt1.04□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 CHS6YJL099W 2241 nt1.04□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 SNU13YEL026W 381 nt1.04□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 OST4YDL232W 111 nt1.03□□□□□ -2.24
YTM1Q12024 YSP1YHR155W 3687 nt1.03□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.01□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 snR48snR48 113 nt1.01□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 YPR117WYPR117W 7470 nt1.01□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 EMT1tM(CAU)D 73 nt1□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 EMT4tM(CAU)M 73 nt1□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 BEM3YPL115C 3387 nt0.99□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 YOR102WYOR102W 351 nt0.99□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 YJR029WYJR029W 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
YTM1Q12024 YDR544CYDR544C 429 nt0.94□□□□□ -2.26
YTM1Q12024 YBL053WYBL053W 375 nt0.94□□□□□ -2.26
YTM1Q12024 VAM6YDL077C 3150 nt0.94□□□□□ -2.26
YTM1Q12024 RPM2YML091C 3609 nt0.94□□□□□ -2.26
YTM1Q12024 BEM2YER155C 6504 nt0.94□□□□□ -2.26
YTM1Q12024 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.93□□□□□ -2.26
YTM1Q12024 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.92□□□□□ -2.26
YTM1Q12024 SEC1YDR164C 2175 nt0.91□□□□□ -2.26
YTM1Q12024 LTE1YAL024C 4308 nt0.9□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 COG6YNL041C 2520 nt0.9□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.89□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.89□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.89□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 BUD3YCL014W 4911 nt0.88□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.88□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 NNF2YGR089W 2811 nt0.87□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 ULP2YIL031W 3105 nt0.86□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.85□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 GLG1YKR058W 1851 nt0.85□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 DOP1YDR141C 5097 nt0.84□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 SDH6YDR379C-A 240 nt0.84□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.84□□□□□ -2.27
YTM1Q12024 STF2YGR008C 255 nt0.83□□□□□ -2.28
YTM1Q12024 PAU24YBR301W 363 nt0.83□□□□□ -2.28
YTM1Q12024 QCR9YGR183C 201 nt0.82□□□□□ -2.28
YTM1Q12024 PET111YMR257C 2403 nt0.81□□□□□ -2.28
YTM1Q12024 snR39BsnR39B 96 nt0.8□□□□□ -2.28
YTM1Q12024 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.79□□□□□ -2.28
YTM1Q12024 HUG1YML058W-A 207 nt0.79□□□□□ -2.28
YTM1Q12024 YDR210WYDR210W 228 nt0.78□□□□□ -2.28
YTM1Q12024 NIP1YMR309C 2439 nt0.77□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 YGR164WYGR164W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.77□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.76□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 BUL2YML111W 2763 nt0.76□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 PAU12YGR294W 363 nt0.75□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 RPS26AYGL189C 360 nt0.73□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.73□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.72□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.72□□□□□ -2.29
YTM1Q12024 MLP1YKR095W 5628 nt0.7□□□□□ -2.3
YTM1Q12024 CSE1YGL238W 2883 nt0.68□□□□□ -2.3
YTM1Q12024 ATP8Q0080 147 nt0.67□□□□□ -2.3
YTM1Q12024 SBH1YER087C-B 249 nt0.66□□□□□ -2.3
YTM1Q12024 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 YNL170WYNL170W 396 nt0.65□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 UTP10YJL109C 5310 nt0.64□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 ORC3YLL004W 1851 nt0.64□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 Q0092Q0092 141 nt0.63□□□□□ -2.31
YTM1Q12024 YMR160WYMR160W 2451 nt0.62□□□□□ -2.31
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