Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL16A1Q07092 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL16A1Q07092 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms