Protein–RNA interactions for Protein: Q03818

ATG16, Autophagy protein 16, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG16Q03818 IQG1YPL242C 4488 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG16Q03818 MLP1YKR095W 5628 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG16Q03818 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG16Q03818 COX12YLR038C 252 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG16Q03818 RPS30BYOR182C 192 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG16Q03818 snR55snR55 98 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG16Q03818 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG16Q03818 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG16Q03818 YKU70YMR284W 1809 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG16Q03818 YER181CYER181C 324 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG16Q03818 YOR345CYOR345C 351 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG16Q03818 PET111YMR257C 2403 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG16Q03818 STF2YGR008C 255 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG16Q03818 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG16Q03818 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG16Q03818 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG16Q03818 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG16Q03818 YDR366CYDR366C 399 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 PAU12YGR294W 363 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 HUG1YML058W-A 207 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 NNF2YGR089W 2811 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 TRS65YGR166W 1683 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 YMR160WYMR160W 2451 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 UTP10YJL109C 5310 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 SNU13YEL026W 381 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 MLP2YIL149C 5040 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 BUD3YCL014W 4911 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG16Q03818 SBH1YER087C-B 249 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG16Q03818 ABF2YMR072W 552 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG16Q03818 UTP8YGR128C 2142 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG16Q03818 RPM2YML091C 3609 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG16Q03818 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG16Q03818 APQ12YIL040W 417 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG16Q03818 NIP1YMR309C 2439 nt0.53□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 YLR232WYLR232W 348 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 UTP20YBL004W 7482 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 RPS26AYGL189C 360 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.51□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 YGL041CYGL041C 204 nt0.5□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 ULP2YIL031W 3105 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 BUL2YML111W 2763 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 FMP27YLR454W 7887 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG16Q03818 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG16Q03818 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG16Q03818 PRP39YML046W 1890 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG16Q03818 YOR302WYOR302W 78 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG16Q03818 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG16Q03818 GLG1YKR058W 1851 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG16Q03818 ORC3YLL004W 1851 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG16Q03818 TAH1YCR060W 336 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG16Q03818 snR8snR8 190 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG16Q03818 BIR1YJR089W 2865 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 snR80snR80 171 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 RCO1YMR075W 2055 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.36□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG16Q03818 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.34□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.34□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 YGL182CYGL182C 324 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 YJL182CYJL182C 318 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 SDH6YDR379C-A 240 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 YEL073CYEL073C 324 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 ESP1YGR098C 4893 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 COG6YNL041C 2520 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 AI1Q0050 2505 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 YEL014CYEL014C 306 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG16Q03818 YDR544CYDR544C 429 nt0.27□□□□□ -2.37
ATG16Q03818 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.26□□□□□ -2.37
ATG16Q03818 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.25□□□□□ -2.37
ATG16Q03818 snR46snR46 197 nt0.25□□□□□ -2.37
ATG16Q03818 CSE1YGL238W 2883 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG16Q03818 QCR9YGR183C 201 nt0.23□□□□□ -2.37
ATG16Q03818 YOR170WYOR170W 306 nt0.23□□□□□ -2.37
ATG16Q03818 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.22□□□□□ -2.37
ATG16Q03818 YOL014WYOL014W 375 nt0.2□□□□□ -2.38
ATG16Q03818 YBR099CYBR099C 384 nt0.19□□□□□ -2.38
ATG16Q03818 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG16Q03818 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG16Q03818 snR52snR52 92 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG16Q03818 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG16Q03818 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG16Q03818 SOV1YMR066W 2697 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG16Q03818 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.09□□□□□ -2.4
ATG16Q03818 SPG3YDR504C 384 nt0.07□□□□□ -2.4
ATG16Q03818 YDR210WYDR210W 228 nt0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms