Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms