Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNU13P55769 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms