Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GEMP55040 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GEMP55040 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GEMP55040 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GEMP55040 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GEMP55040 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEMP55040 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEMP55040 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GEMP55040 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEMP55040 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GEMP55040 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms