Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

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Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 RPS30AYLR287C-A 192 nt-2.85□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-2.86□□□□□ -2.87
SSK2P53599 BI2Q0110 1272 nt-2.86□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YLR202CYLR202C 327 nt-2.86□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-2.86□□□□□ -2.87
SSK2P53599 RPS27BYHR021C 249 nt-2.87□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YNL303WYNL303W 348 nt-2.87□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YCR001WYCR001W 315 nt-2.87□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YER090C-AYER090C-A 90 nt-2.87□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YGL230CYGL230C 444 nt-2.89□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YLR334CYLR334C 381 nt-2.9□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YAF9YNL107W 681 nt-2.9□□□□□ -2.87
SSK2P53599 YFL012WYFL012W 447 nt-2.92□□□□□ -2.88
SSK2P53599 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-2.92□□□□□ -2.88
SSK2P53599 YKL083WYKL083W 615 nt-2.92□□□□□ -2.88
SSK2P53599 YML054C-AYML054C-A 159 nt-2.92□□□□□ -2.88
SSK2P53599 YDR048CYDR048C 315 nt-2.93□□□□□ -2.88
SSK2P53599 YNL266WYNL266W 420 nt-2.95□□□□□ -2.88
SSK2P53599 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-2.97□□□□□ -2.89
SSK2P53599 YOR309CYOR309C 381 nt-2.97□□□□□ -2.89
SSK2P53599 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-2.98□□□□□ -2.89
SSK2P53599 YDR220CYDR220C 294 nt-2.99□□□□□ -2.89
SSK2P53599 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-2.99□□□□□ -2.89
SSK2P53599 PRM3YPL192C 402 nt-3.01□□□□□ -2.89
SSK2P53599 MRPL32YCR003W 552 nt-3.02□□□□□ -2.89
SSK2P53599 BUD26YDR241W 288 nt-3.02□□□□□ -2.89
SSK2P53599 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-3.04□□□□□ -2.9
SSK2P53599 YJR162CYJR162C 351 nt-3.05□□□□□ -2.9
SSK2P53599 YNL337WYNL337W 255 nt-3.05□□□□□ -2.9
SSK2P53599 GPI15YNL038W 690 nt-3.07□□□□□ -2.9
SSK2P53599 YPR039WYPR039W 336 nt-3.07□□□□□ -2.9
SSK2P53599 snR50snR50 90 nt-3.07□□□□□ -2.9
SSK2P53599 ATP19YOL077W-A 207 nt-3.08□□□□□ -2.9
SSK2P53599 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-3.08□□□□□ -2.9
SSK2P53599 YNL171CYNL171C 369 nt-3.1□□□□□ -2.91
SSK2P53599 IRC13YOR235W 315 nt-3.1□□□□□ -2.91
SSK2P53599 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-3.12□□□□□ -2.91
SSK2P53599 POP6YGR030C 477 nt-3.12□□□□□ -2.91
SSK2P53599 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-3.14□□□□□ -2.91
SSK2P53599 TOM22YNL131W 459 nt-3.15□□□□□ -2.91
SSK2P53599 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-3.16□□□□□ -2.91
SSK2P53599 YDR544CYDR544C 429 nt-3.17□□□□□ -2.92
SSK2P53599 snR67snR67 82 nt-3.19□□□□□ -2.92
SSK2P53599 YDR426CYDR426C 378 nt-3.2□□□□□ -2.92
SSK2P53599 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-3.21□□□□□ -2.92
SSK2P53599 YLR269CYLR269C 351 nt-3.23□□□□□ -2.93
SSK2P53599 YIL029CYIL029C 429 nt-3.24□□□□□ -2.93
SSK2P53599 snR69snR69 101 nt-3.26□□□□□ -2.93
SSK2P53599 YDL011CYDL011C 324 nt-3.27□□□□□ -2.93
SSK2P53599 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-3.29□□□□□ -2.94
SSK2P53599 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-3.35□□□□□ -2.95
SSK2P53599 YGR069WYGR069W 336 nt-3.36□□□□□ -2.95
SSK2P53599 YML099W-AYML099W-A 330 nt-3.36□□□□□ -2.95
SSK2P53599 YLR217WYLR217W 324 nt-3.4□□□□□ -2.95
SSK2P53599 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-3.4□□□□□ -2.95
SSK2P53599 YDR102CYDR102C 333 nt-3.42□□□□□ -2.96
SSK2P53599 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-3.44□□□□□ -2.96
SSK2P53599 PCC1YKR095W-A 267 nt-3.45□□□□□ -2.96
SSK2P53599 YGL149WYGL149W 306 nt-3.49□□□□□ -2.97
SSK2P53599 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-3.5□□□□□ -2.97
SSK2P53599 TSC3YBR058C-A 243 nt-3.52□□□□□ -2.97
SSK2P53599 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-3.55□□□□□ -2.98
SSK2P53599 snR9snR9 187 nt-3.55□□□□□ -2.98
SSK2P53599 YER137W-AYER137W-A 306 nt-3.55□□□□□ -2.98
SSK2P53599 YBL071CYBL071C 309 nt-3.55□□□□□ -2.98
SSK2P53599 HMRA1YCR097W 381 nt-3.58□□□□□ -2.98
SSK2P53599 YDL158CYDL158C 309 nt-3.59□□□□□ -2.98
SSK2P53599 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-3.6□□□□□ -2.99
SSK2P53599 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-3.61□□□□□ -2.99
SSK2P53599 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-3.63□□□□□ -2.99
SSK2P53599 snR57snR57 88 nt-3.71□□□□□ -3
SSK2P53599 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-3.71□□□□□ -3
SSK2P53599 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-3.73□□□□□ -3.01
SSK2P53599 YER097WYER097W 330 nt-3.73□□□□□ -3.01
SSK2P53599 YER175W-AYER175W-A 165 nt-3.75□□□□□ -3.01
SSK2P53599 YER181CYER181C 324 nt-3.8□□□□□ -3.02
SSK2P53599 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-3.8□□□□□ -3.02
SSK2P53599 YDL016CYDL016C 303 nt-3.8□□□□□ -3.02
SSK2P53599 YPR197CYPR197C 564 nt-3.81□□□□□ -3.02
SSK2P53599 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-3.83□□□□□ -3.02
SSK2P53599 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-3.85□□□□□ -3.02
SSK2P53599 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-3.85□□□□□ -3.03
SSK2P53599 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.88□□□□□ -3.03
SSK2P53599 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-3.88□□□□□ -3.03
SSK2P53599 YAR047CYAR047C 321 nt-3.89□□□□□ -3.03
SSK2P53599 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-3.9□□□□□ -3.03
SSK2P53599 STE18YJR086W 333 nt-3.92□□□□□ -3.04
SSK2P53599 snR55snR55 98 nt-3.93□□□□□ -3.04
SSK2P53599 ATG16YMR159C 453 nt-3.93□□□□□ -3.04
SSK2P53599 AI5_BETAQ0075 1065 nt-3.95□□□□□ -3.04
SSK2P53599 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-3.96□□□□□ -3.04
SSK2P53599 snR6snR6 112 nt-3.99□□□□□ -3.05
SSK2P53599 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-4.01□□□□□ -3.05
SSK2P53599 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-4.02□□□□□ -3.05
SSK2P53599 YBR178WYBR178W 375 nt-4.02□□□□□ -3.05
SSK2P53599 YFL032WYFL032W 321 nt-4.04□□□□□ -3.06
SSK2P53599 YFL019CYFL019C 354 nt-4.06□□□□□ -3.06
SSK2P53599 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-4.07□□□□□ -3.06
SSK2P53599 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-4.08□□□□□ -3.06
SSK2P53599 YJR157WYJR157W 363 nt-4.09□□□□□ -3.06
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