Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGDP52209 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGDP52209 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PGDP52209 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGDP52209 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGDP52209 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGDP52209 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGDP52209 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGDP52209 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGDP52209 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGDP52209 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGDP52209 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGDP52209 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGDP52209 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGDP52209 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGDP52209 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGDP52209 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms