Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DAP3P51398 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DAP3P51398 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms