Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSEN1P49768 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSEN1P49768 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms