Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF4P48230 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms