Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA8P48165 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA8P48165 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA8P48165 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms