Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA4P48058 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms