Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA4P43681 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA4P43681 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms