Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFMP43652 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFMP43652 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFMP43652 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFMP43652 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFMP43652 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFMP43652 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFMP43652 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFMP43652 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFMP43652 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFMP43652 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFMP43652 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFMP43652 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AFMP43652 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms