Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER2P43116 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER2P43116 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms