Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP8P40818 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP8P40818 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP8P40818 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP8P40818 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP8P40818 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP8P40818 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP8P40818 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms