Protein–RNA interactions for Protein: P40218

YMR147W, Uncharacterized protein YMR147W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR147WP40218 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 COX5BYIL111W 456 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 YOR345CYOR345C 351 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 RKR1YMR247C 4689 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 snR80snR80 171 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 BEM3YPL115C 3387 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR147WP40218 COX12YLR038C 252 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 FYV10YIL097W 1551 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 QCR9YGR183C 201 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 PAU12YGR294W 363 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 YMR160WYMR160W 2451 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 YEL014CYEL014C 306 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 CHS6YJL099W 2241 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 ASE1YOR058C 2658 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 APQ12YIL040W 417 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 YOR302WYOR302W 78 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR147WP40218 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 TRS65YGR166W 1683 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 PRP42YDR235W 1635 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 SPG3YDR504C 384 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 PRP5YBR237W 2550 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 OST4YDL232W 111 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR147WP40218 YSP1YHR155W 3687 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 PET111YMR257C 2403 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 SNU13YEL026W 381 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 YLR041WYLR041W 321 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 YLR232WYLR232W 348 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 LTE1YAL024C 4308 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 YOL014WYOL014W 375 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 snR52snR52 92 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 HAL9YOL089C 3093 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 TAH1YCR060W 336 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 JLP2YMR132C 627 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 NNF2YGR089W 2811 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 YJL182CYJL182C 318 nt0.59□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.59□□□□□ -2.31
YMR147WP40218 UTP20YBL004W 7482 nt0.59□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 YEL073CYEL073C 324 nt0.58□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 FMP27YLR454W 7887 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 MLP1YKR095W 5628 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 ULP2YIL031W 3105 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 PRP39YML046W 1890 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 YDR544CYDR544C 429 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 YGL182CYGL182C 324 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR147WP40218 SBH1YER087C-B 249 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR147WP40218 CSE1YGL238W 2883 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR147WP40218 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR147WP40218 snR46snR46 197 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR147WP40218 GLG1YKR058W 1851 nt0.48□□□□□ -2.33
YMR147WP40218 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR147WP40218 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.46□□□□□ -2.34
YMR147WP40218 RPS26AYGL189C 360 nt0.46□□□□□ -2.34
YMR147WP40218 NIP1YMR309C 2439 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR147WP40218 SDH6YDR379C-A 240 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR147WP40218 COG6YNL041C 2520 nt0.44□□□□□ -2.34
YMR147WP40218 BIR1YJR089W 2865 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR147WP40218 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR147WP40218 YOR170WYOR170W 306 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR147WP40218 ORC3YLL004W 1851 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR147WP40218 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.4□□□□□ -2.35
YMR147WP40218 AI1Q0050 2505 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR147WP40218 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR147WP40218 YJL150WYJL150W 303 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR147WP40218 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR147WP40218 YDR210WYDR210W 228 nt0.34□□□□□ -2.36
YMR147WP40218 YNL337WYNL337W 255 nt0.34□□□□□ -2.36
YMR147WP40218 snR39BsnR39B 96 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR147WP40218 RCO1YMR075W 2055 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR147WP40218 YOR102WYOR102W 351 nt0.32□□□□□ -2.36
YMR147WP40218 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.32□□□□□ -2.36
YMR147WP40218 YGR151CYGR151C 336 nt0.31□□□□□ -2.36
YMR147WP40218 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.3□□□□□ -2.36
YMR147WP40218 ESP1YGR098C 4893 nt0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.8 ms