Protein–RNA interactions for Protein: P40030

ERG28, Ergosterol biosynthetic protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ERG28P40030 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-0.46□□□□□ -2.48
ERG28P40030 YDR048CYDR048C 315 nt-0.47□□□□□ -2.48
ERG28P40030 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.47□□□□□ -2.48
ERG28P40030 YOR121CYOR121C 306 nt-0.47□□□□□ -2.48
ERG28P40030 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.48□□□□□ -2.49
ERG28P40030 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.48□□□□□ -2.49
ERG28P40030 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.48□□□□□ -2.49
ERG28P40030 snR46snR46 197 nt-0.48□□□□□ -2.49
ERG28P40030 SEC10YLR166C 2616 nt-0.49□□□□□ -2.49
ERG28P40030 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.49□□□□□ -2.49
ERG28P40030 YER137W-AYER137W-A 306 nt-0.5□□□□□ -2.49
ERG28P40030 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.5□□□□□ -2.49
ERG28P40030 YBR285WYBR285W 435 nt-0.5□□□□□ -2.49
ERG28P40030 GLG1YKR058W 1851 nt-0.5□□□□□ -2.49
ERG28P40030 YDR544CYDR544C 429 nt-0.51□□□□□ -2.49
ERG28P40030 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.51□□□□□ -2.49
ERG28P40030 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-0.52□□□□□ -2.49
ERG28P40030 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-0.53□□□□□ -2.49
ERG28P40030 snR60snR60 104 nt-0.54□□□□□ -2.5
ERG28P40030 UTP8YGR128C 2142 nt-0.54□□□□□ -2.5
ERG28P40030 AGA2YGL032C 264 nt-0.55□□□□□ -2.5
ERG28P40030 YGR069WYGR069W 336 nt-0.55□□□□□ -2.5
ERG28P40030 APQ12YIL040W 417 nt-0.55□□□□□ -2.5
ERG28P40030 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.55□□□□□ -2.5
ERG28P40030 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.55□□□□□ -2.5
ERG28P40030 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.55□□□□□ -2.5
ERG28P40030 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.55□□□□□ -2.5
ERG28P40030 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.57□□□□□ -2.5
ERG28P40030 URB1YKL014C 5295 nt-0.58□□□□□ -2.5
ERG28P40030 YER079WYER079W 633 nt-0.58□□□□□ -2.5
ERG28P40030 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-0.58□□□□□ -2.5
ERG28P40030 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.59□□□□□ -2.5
ERG28P40030 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.59□□□□□ -2.5
ERG28P40030 snR36snR36 182 nt-0.59□□□□□ -2.5
ERG28P40030 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.6□□□□□ -2.51
ERG28P40030 YNL324WYNL324W 396 nt-0.6□□□□□ -2.51
ERG28P40030 TAH1YCR060W 336 nt-0.63□□□□□ -2.51
ERG28P40030 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.64□□□□□ -2.51
ERG28P40030 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.64□□□□□ -2.51
ERG28P40030 COG6YNL041C 2520 nt-0.64□□□□□ -2.51
ERG28P40030 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-0.65□□□□□ -2.51
ERG28P40030 HMRA1YCR097W 381 nt-0.66□□□□□ -2.52
ERG28P40030 YIL032CYIL032C 357 nt-0.66□□□□□ -2.52
ERG28P40030 snR33snR33 183 nt-0.68□□□□□ -2.52
ERG28P40030 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.7□□□□□ -2.52
ERG28P40030 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.7□□□□□ -2.52
ERG28P40030 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.7□□□□□ -2.52
ERG28P40030 YGL052WYGL052W 306 nt-0.71□□□□□ -2.52
ERG28P40030 YGR035CYGR035C 351 nt-0.71□□□□□ -2.52
ERG28P40030 YNL028WYNL028W 318 nt-0.71□□□□□ -2.52
ERG28P40030 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.74□□□□□ -2.53
ERG28P40030 YOR015WYOR015W 360 nt-0.74□□□□□ -2.53
ERG28P40030 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.74□□□□□ -2.53
ERG28P40030 RPM2YML091C 3609 nt-0.74□□□□□ -2.53
ERG28P40030 HTL1YCR020W-B 237 nt-0.75□□□□□ -2.53
ERG28P40030 snR74snR74 88 nt-0.75□□□□□ -2.53
ERG28P40030 ATP6Q0085 780 nt-0.75□□□□□ -2.53
ERG28P40030 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.76□□□□□ -2.53
ERG28P40030 snR49snR49 165 nt-0.76□□□□□ -2.53
ERG28P40030 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.76□□□□□ -2.53
ERG28P40030 YJR157WYJR157W 363 nt-0.77□□□□□ -2.53
ERG28P40030 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-0.77□□□□□ -2.53
ERG28P40030 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
ERG28P40030 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
ERG28P40030 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
ERG28P40030 YAF9YNL107W 681 nt-0.79□□□□□ -2.54
ERG28P40030 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.79□□□□□ -2.54
ERG28P40030 YGL149WYGL149W 306 nt-0.8□□□□□ -2.54
ERG28P40030 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.8□□□□□ -2.54
ERG28P40030 YJL182CYJL182C 318 nt-0.8□□□□□ -2.54
ERG28P40030 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-0.8□□□□□ -2.54
ERG28P40030 YFL032WYFL032W 321 nt-0.82□□□□□ -2.54
ERG28P40030 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-0.82□□□□□ -2.54
ERG28P40030 YGL041CYGL041C 204 nt-0.85□□□□□ -2.55
ERG28P40030 YGL182CYGL182C 324 nt-0.85□□□□□ -2.55
ERG28P40030 snR69snR69 101 nt-0.86□□□□□ -2.55
ERG28P40030 YDR102CYDR102C 333 nt-0.86□□□□□ -2.55
ERG28P40030 snR50snR50 90 nt-0.86□□□□□ -2.55
ERG28P40030 Q0017Q0017 162 nt-0.87□□□□□ -2.55
ERG28P40030 YOR170WYOR170W 306 nt-0.89□□□□□ -2.55
ERG28P40030 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.89□□□□□ -2.55
ERG28P40030 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.9□□□□□ -2.55
ERG28P40030 YNL266WYNL266W 420 nt-0.9□□□□□ -2.55
ERG28P40030 YEL014CYEL014C 306 nt-0.92□□□□□ -2.56
ERG28P40030 YER097WYER097W 330 nt-0.92□□□□□ -2.56
ERG28P40030 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.93□□□□□ -2.56
ERG28P40030 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-0.93□□□□□ -2.56
ERG28P40030 snR161snR161 161 nt-0.93□□□□□ -2.56
ERG28P40030 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.94□□□□□ -2.56
ERG28P40030 RDS3YPR094W 324 nt-0.94□□□□□ -2.56
ERG28P40030 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-0.96□□□□□ -2.56
ERG28P40030 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.96□□□□□ -2.56
ERG28P40030 YFL019CYFL019C 354 nt-0.97□□□□□ -2.56
ERG28P40030 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-0.97□□□□□ -2.56
ERG28P40030 snR39BsnR39B 96 nt-0.97□□□□□ -2.56
ERG28P40030 JLP2YMR132C 627 nt-0.98□□□□□ -2.57
ERG28P40030 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.98□□□□□ -2.57
ERG28P40030 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-0.98□□□□□ -2.57
ERG28P40030 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.99□□□□□ -2.57
ERG28P40030 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms