Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LTBRP36941 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LTBRP36941 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTBRP36941 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms