Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	YGR069W	YGR069W	336 nt		0.09	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		0.09	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YAF9	YNL107W	681 nt		0.09	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	snR60	snR60	104 nt		0.08	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YGL123C-A	YGL123C-A	231 nt		0.08	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	MYO1	YHR023W	5787 nt		0.08	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		0.06	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	BLI1	YKL061W	342 nt		0.06	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YIL032C	YIL032C	357 nt		0.05	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YKU70	YMR284W	1809 nt		0.05	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	SOV1	YMR066W	2697 nt		0.04	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	PRP39	YML046W	1890 nt		0.04	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		0.04	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YLL019W-A	YLL019W-A	93 nt		0.04	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	SNU13	YEL026W	381 nt		0.03	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YEL073C	YEL073C	324 nt		0.03	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		0.03	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YOR015W	YOR015W	360 nt		0.03	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		0.03	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	snR45	snR45	172 nt		0.03	□□□□□ -2.4
VMA11	P32842	YKL100W-A	YKL100W-A	90 nt		0.02	□□□□□ -2.41
VMA11	P32842	COX12	YLR038C	252 nt		0.02	□□□□□ -2.41
VMA11	P32842	YFL019C	YFL019C	354 nt		0.01	□□□□□ -2.41
VMA11	P32842	YPR012W	YPR012W	255 nt		0	□□□□□ -2.41
VMA11	P32842	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
VMA11	P32842	YMR193C-A	YMR193C-A	387 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
VMA11	P32842	YDR366C	YDR366C	399 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
VMA11	P32842	YNL028W	YNL028W	318 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
VMA11	P32842	ATP6	Q0085	780 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	YPR197C	YPR197C	564 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	HMRA1	YCR097W	381 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	snR36	snR36	182 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	snR74	snR74	88 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	YGL149W	YGL149W	306 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
VMA11	P32842	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	YFL032W	YFL032W	321 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	GLG1	YKR058W	1851 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	RAD61	YDR014W	1944 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	YLR232W	YLR232W	348 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	YGL052W	YGL052W	306 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	YBR099C	YBR099C	384 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	YER097W	YER097W	330 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
VMA11	P32842	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	TAH1	YCR060W	336 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	SDH6	YDR379C-A	240 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	APQ12	YIL040W	417 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	RPL39	YJL189W	156 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	CSE1	YGL238W	2883 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	snR8	snR8	190 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	YDR413C	YDR413C	576 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	YKL118W	YKL118W	312 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	snR128	snR128	126 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	EST1	YLR233C	2100 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	GIM4	YEL003W	336 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
VMA11	P32842	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
VMA11	P32842	COG6	YNL041C	2520 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
VMA11	P32842	YGR164W	YGR164W	336 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
VMA11	P32842	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
VMA11	P32842	YDR544C	YDR544C	429 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
VMA11	P32842	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
VMA11	P32842	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
VMA11	P32842	YDR210W	YDR210W	228 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
VMA11	P32842	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
VMA11	P32842	YML099W-A	YML099W-A	330 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
VMA11	P32842	YER181C	YER181C	324 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
VMA11	P32842	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
VMA11	P32842	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
VMA11	P32842	YGL041C	YGL041C	204 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
VMA11	P32842	YGL182C	YGL182C	324 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
VMA11	P32842	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
VMA11	P32842	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
VMA11	P32842	snR46	snR46	197 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
VMA11	P32842	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
VMA11	P32842	snR56	snR56	88 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	snR65	snR65	100 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	YJL182C	YJL182C	318 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	snR49	snR49	165 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	SEC10	YLR166C	2616 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	snR55	snR55	98 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	YEL014C	YEL014C	306 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	YOR170W	YOR170W	306 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
VMA11	P32842	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-0.47	□□□□□ -2.48

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