Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA13P31271 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms