Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.29□□□□□ -2.2
PRP45P28004 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.29□□□□□ -2.2
PRP45P28004 SPT7YBR081C 3999 nt1.29□□□□□ -2.2
PRP45P28004 YPL044CYPL044C 549 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP45P28004 SEC21YNL287W 2808 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP45P28004 KAP120YPL125W 3099 nt1.27□□□□□ -2.21
PRP45P28004 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.27□□□□□ -2.21
PRP45P28004 YJR029WYJR029W 5268 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP45P28004 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP45P28004 YEL073CYEL073C 324 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP45P28004 YLR294CYLR294C 330 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP45P28004 YLR282CYLR282C 342 nt1.25□□□□□ -2.21
PRP45P28004 UTP8YGR128C 2142 nt1.24□□□□□ -2.21
PRP45P28004 RPL26BYGR034W 384 nt1.24□□□□□ -2.21
PRP45P28004 UBP3YER151C 2739 nt1.23□□□□□ -2.21
PRP45P28004 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.23□□□□□ -2.21
PRP45P28004 ASE1YOR058C 2658 nt1.22□□□□□ -2.21
PRP45P28004 snR190snR190 190 nt1.21□□□□□ -2.22
PRP45P28004 PRP5YBR237W 2550 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP45P28004 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP45P28004 YML002WYML002W 2214 nt1.19□□□□□ -2.22
PRP45P28004 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.19□□□□□ -2.22
PRP45P28004 BEM2YER155C 6504 nt1.19□□□□□ -2.22
PRP45P28004 PRP42YDR235W 1635 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP45P28004 COX5BYIL111W 456 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP45P28004 PRP16YKR086W 3216 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP45P28004 FYV10YIL097W 1551 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP45P28004 YMR160WYMR160W 2451 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP45P28004 NST1YNL091W 3723 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP45P28004 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP45P28004 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP45P28004 BFR2YDR299W 1605 nt1.15□□□□□ -2.22
PRP45P28004 RAD9YDR217C 3930 nt1.15□□□□□ -2.23
PRP45P28004 SEC8YPR055W 3198 nt1.1□□□□□ -2.23
PRP45P28004 TAH1YCR060W 336 nt1.1□□□□□ -2.23
PRP45P28004 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.1□□□□□ -2.23
PRP45P28004 YLR041WYLR041W 321 nt1.1□□□□□ -2.23
PRP45P28004 YBL053WYBL053W 375 nt1.1□□□□□ -2.23
PRP45P28004 YPR117WYPR117W 7470 nt1.09□□□□□ -2.23
PRP45P28004 RKR1YMR247C 4689 nt1.09□□□□□ -2.24
PRP45P28004 YDL073WYDL073W 2955 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP45P28004 YDR544CYDR544C 429 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP45P28004 YGL182CYGL182C 324 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP45P28004 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP45P28004 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP45P28004 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP45P28004 BEM3YPL115C 3387 nt1.05□□□□□ -2.24
PRP45P28004 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.05□□□□□ -2.24
PRP45P28004 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.05□□□□□ -2.24
PRP45P28004 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.05□□□□□ -2.24
PRP45P28004 YLR232WYLR232W 348 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP45P28004 YOR102WYOR102W 351 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP45P28004 MYO1YHR023W 5787 nt1.01□□□□□ -2.25
PRP45P28004 SCC2YDR180W 4482 nt1□□□□□ -2.25
PRP45P28004 SNU13YEL026W 381 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 CHS6YJL099W 2241 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP45P28004 BIR1YJR089W 2865 nt0.98□□□□□ -2.25
PRP45P28004 snR48snR48 113 nt0.98□□□□□ -2.25
PRP45P28004 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP45P28004 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP45P28004 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP45P28004 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP45P28004 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP45P28004 RPM2YML091C 3609 nt0.96□□□□□ -2.26
PRP45P28004 YOR170WYOR170W 306 nt0.96□□□□□ -2.26
PRP45P28004 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP45P28004 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.94□□□□□ -2.26
PRP45P28004 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.94□□□□□ -2.26
PRP45P28004 OST4YDL232W 111 nt0.92□□□□□ -2.26
PRP45P28004 Q0092Q0092 141 nt0.92□□□□□ -2.26
PRP45P28004 SEC1YDR164C 2175 nt0.91□□□□□ -2.26
PRP45P28004 ATP8Q0080 147 nt0.91□□□□□ -2.26
PRP45P28004 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.91□□□□□ -2.26
PRP45P28004 YSP1YHR155W 3687 nt0.91□□□□□ -2.26
PRP45P28004 YGR164WYGR164W 336 nt0.9□□□□□ -2.27
PRP45P28004 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.89□□□□□ -2.27
PRP45P28004 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.87□□□□□ -2.27
PRP45P28004 COG6YNL041C 2520 nt0.87□□□□□ -2.27
PRP45P28004 LTE1YAL024C 4308 nt0.87□□□□□ -2.27
PRP45P28004 YDR210WYDR210W 228 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP45P28004 SDH6YDR379C-A 240 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP45P28004 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP45P28004 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP45P28004 YNL170WYNL170W 396 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP45P28004 ULP2YIL031W 3105 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP45P28004 snR39BsnR39B 96 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP45P28004 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP45P28004 FMP27YLR454W 7887 nt0.83□□□□□ -2.28
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