Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRGP23470 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
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