Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARF4P18085 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARF4P18085 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARF4P18085 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARF4P18085 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARF4P18085 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARF4P18085 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF4P18085 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARF4P18085 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms