Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOP2AP11388 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms